Kerjaya beliau bermula sebagau guru di Victoria Institution dan Maktab Tentera Diraja Malaysia; Penolong Setiausaha Majlis Bandaraya George Town; Setiausaha Sulit kepada Ketua Menteri Pulau Pinang; Pengarah Perbadanan Pembangunan Pulau Pinang.

Dalam politik, Anwar Fazal terlibat dalam pelbagai parti politik seperti Barisan Sosialis, Parti Perikatan, Gerakan, Majlis Gerakan Negara (MAGERAN) dan Barisan Nasional. Dia meninggalkan semua itu untuk bekerja sepenuh masa demi masyarakat sivil, terutamanya Pertubuhan Antarabangsa Kesatuan Pengguna (IOCU), kini dikenali sebagai Pengguna Antarabangsa (IS). Pada tahun 1972, beliau telah dianugerahkan biasiswa Fellowship Eisenhower berprestij untuk mengkaji hal ehwal bandar di Amerika Syarikat dan pergi ke Britain di bawah Program British Council untuk belajar bandar-bandar baru di United Kingdom.

Anwar Fazal berkhidmat sebagai Penasihat Kanan Serantau dengan Program Pembangunan Pertubuhan Bangsa-Bangsa Bersatu (UNDP) 1991-2004 dengan tiga inisiatif untuk menyokong kerja-kerja komuniti untuk memperbaiki persekitaran bandar dan menggalakkan tadbir urus yang baik - Asia Pasifik 2000, Program Pengurusan Bandar bagi Asia dan Pasifik dan Inisiatif Tadbir Urus Bandar.

Kini beliau menjadi Pengerusi Emeritus Perikatan Dunia Tindakan Penyusuan Susu Ibu (WABA) yang ditubuhkan pada tahun 1991.

Beliau juga berkhidmat sebagai Pengerusi Inisiatif Keamanan Taiping dan Rangkaian Antara Agama Malaysia dan Lembaga Warga International, Sahabat Alam Malaysia, Rangkaian Tindakan Racun Makhluk Perosak (PAN), Transparency International Malaysia, Friends of the Taman Botani Pulau Pinang Society, Penang Free School (PFS) Yayasan dan Pemegang Amanah Warisan Pulau Pinang.

Tulisan dan ucapan beliau sepanjang tempoh 35 tahun sentiasa memperjuangkan pengguna dan alam sekitar. Pelbagai isu telah diutarakannya daripada pengguna, kesihatan, alam sekitar, keamanan, rasuah dan integriti. Isterinya, Mahmuda ialah sumber inspirasi beliau, kekuatan dan keberanian dan kesabaran dan sokongan dia juga akan lebih mesra mengakui.[Penjelasan diperlukan]